日本学校中国承认吗？
首先，要分清楚两个概念“认可”与“承认” 教育部对出国学习所做的审批是允许你以高中同等学力申请国外本科；而承认你的学历则是接受你这个学历的人（单位、公司）有多。换句话说就是你是这个学校的毕业生的话，理论上你毕业证上的学校名称是被认可的。也就是承认。然而有些人因为种种问题可能没有完成所有课程或没有通过考试而导致拿不到毕业证，这个时候即便你是这个学校毕业的也没人承认你就是有这个学历的。所以承认不认可不能光看名字是否被认可还得看看具体的情况。
至于题主所提到日本的一个叫做修士的课程两年制是不是研究生，我不敢断言，毕竟没接触过这方面的信息。但是一般来说能够申请到修士课程的学习者都是拥有本科学历的。（个别专业除外，比如建筑学。）而拥有本科学历的基本上都能授予硕士学位。因此从这一点上来说修士课程毕业得到的硕士学位被承认的可能性比较大。 但是如果像楼上所说能考进东大、京大这样的学校，那就没什么问题了，这些学校出来的肯定都被承认。但问题是能考入这种大学的人是极少数一部分人，而大部分的人由于能力有限只能去一些私校或者一般的国立大学。那么这些人的证书就肯定会被打回去一半，因为国内不认。
另外补充一点，虽然日本的学士和硕士学位在中国都承认，但是双学位的说法是没有的。因为日本的硕士基本上是研究性质的，不是像你想象中的那样混个学位这么简单。所以一般中国人都会再读一个博士以便拿一个中国承认的完整的学位。